Goldfajn nació en Haifa. Se graduó en Economía en la Universidad Federal de Río de Janeiro, recibió una maestría de la Pontificia Universidad Católica de Río de Janeiro y un doctorado del MIT. Fue nombrado Presidente del Banco Central por el Ministro de Finanzas Henrique Meirelles el 12 de mayo de 2016.
El 13 de septiembre de 2021, Goldfajn fue nombrado Director del Departamento del Hemisferio Occidental del FMI por la Directora General Kristalina Georgieva para asumir el cargo el 3 de enero de 2022.
Fue galardonado como el Banquero Central del Año por la revista The Banker en 2017, y Mejor Banquero Central por la revista Global Finance en 2018.
Fue director del Banco Central de Brasil entre 2000 y 2003.
Propuesto por Jair Bolsonaro para presidir el Banco interamericano de Desarrollo.